MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 5602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013124	GGAG	2	8	2135280	2135287	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_013124	TCCC	2	8	2135359	2135366	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5503	NC_013124	GC	3	6	2136357	2136362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_013124	ACC	2	6	2136486	2136491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_013124	CGC	2	6	2136512	2136517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_013124	CGT	2	6	2136567	2136572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_013124	TCGA	2	8	2136674	2136681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5508	NC_013124	TGC	2	6	2136827	2136832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_013124	GGA	2	6	2136868	2136873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_013124	GCC	2	6	2136905	2136910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_013124	CGG	2	6	2136919	2136924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_013124	CGA	2	6	2136946	2136951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_013124	TCC	2	6	2136978	2136983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_013124	GCTT	2	8	2137054	2137061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_013124	CCT	2	6	2137121	2137126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_013124	CGC	2	6	2137197	2137202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_013124	GC	3	6	2137201	2137206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_013124	TCA	2	6	2137208	2137213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_013124	GA	3	6	2137264	2137269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_013124	GCCC	2	8	2137274	2137281	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5521	NC_013124	C	6	6	2138522	2138527	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5522	NC_013124	CGCAC	2	10	2140544	2140553	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5523	NC_013124	CCG	2	6	2140566	2140571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_013124	GC	3	6	2141519	2141524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_013124	CGAT	2	8	2141530	2141537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5526	NC_013124	GAC	2	6	2141549	2141554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_013124	CAG	2	6	2141615	2141620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_013124	CGA	2	6	2141636	2141641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_013124	GAGC	2	8	2141645	2141652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_013124	ACC	2	6	2143219	2143224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_013124	CAG	2	6	2143238	2143243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_013124	CGT	2	6	2143260	2143265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_013124	CGA	2	6	2143308	2143313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_013124	CCTG	2	8	2143329	2143336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_013124	TGA	2	6	2143364	2143369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_013124	CGCT	2	8	2143446	2143453	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_013124	CGA	2	6	2143455	2143460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_013124	ACC	2	6	2143468	2143473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_013124	CTCG	2	8	2143507	2143514	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_013124	GAG	2	6	2143563	2143568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_013124	ACC	2	6	2145627	2145632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_013124	GCC	2	6	2145657	2145662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5543	NC_013124	CCT	2	6	2145922	2145927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_013124	CG	3	6	2146043	2146048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_013124	CGC	2	6	2149780	2149785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_013124	CAC	2	6	2149823	2149828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5547	NC_013124	AGC	2	6	2149840	2149845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_013124	CCAC	2	8	2149887	2149894	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5549	NC_013124	CGC	2	6	2149910	2149915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_013124	CTC	2	6	2149920	2149925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_013124	ACC	2	6	2149953	2149958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5552	NC_013124	GGC	2	6	2149990	2149995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_013124	CCCT	2	8	2151847	2151854	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5554	NC_013124	ACCA	2	8	2151890	2151897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5555	NC_013124	TCCG	2	8	2151912	2151919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_013124	GC	3	6	2151951	2151956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_013124	ACC	2	6	2151966	2151971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_013124	CCG	3	9	2151972	2151980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_013124	GCCT	2	8	2152034	2152041	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_013124	CCCA	2	8	2152056	2152063	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5561	NC_013124	ACC	2	6	2152098	2152103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_013124	CCAACG	2	12	2152148	2152159	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_013124	CGA	2	6	2152165	2152170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_013124	ACCA	2	8	2152176	2152183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_013124	CGAT	2	8	2152226	2152233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5566	NC_013124	CCCT	2	8	2152323	2152330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5567	NC_013124	GCCA	2	8	2152344	2152351	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5568	NC_013124	CTC	2	6	2152393	2152398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_013124	CTC	2	6	2152404	2152409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_013124	CTC	2	6	2152418	2152423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_013124	GGA	2	6	2152432	2152437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_013124	AGCTG	2	10	2153993	2154002	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5573	NC_013124	AGG	2	6	2154020	2154025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_013124	GGA	2	6	2154026	2154031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_013124	CGC	2	6	2154043	2154048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_013124	GGA	2	6	2154056	2154061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_013124	GTT	2	6	2154062	2154067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_013124	AGG	2	6	2154069	2154074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_013124	GCT	2	6	2154161	2154166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_013124	CCG	2	6	2154198	2154203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_013124	CGT	2	6	2154257	2154262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_013124	CGC	2	6	2154280	2154285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5583	NC_013124	ACC	2	6	2154360	2154365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_013124	GCCA	2	8	2154387	2154394	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_013124	ACC	2	6	2154408	2154413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_013124	ACG	2	6	2154450	2154455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_013124	GTGC	2	8	2154478	2154485	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5588	NC_013124	CACC	2	8	2154498	2154505	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5589	NC_013124	CAG	2	6	2154520	2154525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_013124	CAC	3	9	2154550	2154558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_013124	TGC	2	6	2154560	2154565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_013124	CGA	2	6	2154585	2154590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_013124	ACCG	2	8	2154610	2154617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5594	NC_013124	AGCA	2	8	2154632	2154639	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_013124	CT	3	6	2154664	2154669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5596	NC_013124	GCAC	2	8	2154672	2154679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_013124	TCG	2	6	2154728	2154733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_013124	CA	3	6	2154772	2154777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_013124	GCC	2	6	2154790	2154795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_013124	CCTT	2	8	2158076	2158083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_013124	GAG	2	6	2158109	2158114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_013124	GCGAG	2	10	2158131	2158140	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.